Primers used for PCR amplification
.SraB
524 5’- CGC CAT GGC GAG GTG GAG – 3’
525 5’ – GCA TAG GGC GCG CAT AT –3’
sraC
501 5’- TCC TCC CGC GCT AAA GA - 3’
502 5’ – CTC TGT TAA TTA CCT AA - 3’
sraE
532 5’ – TTC GGG TTG AGC ACA TG – 3’
522 5’ – AAA GCG AAT GGA GGG AG – 3’
sraF
511 5’ – TTG CCA AAG TAA AAC AGT G – 3’
512 5’ – GGC GAC AAC AAC AGC GA – 3’
sraH
503 5’ - CGC AAT TGA CTG AAA CAC – 3’
504 5’ - AGT GGC GTC ACG ACG TA – 3’
sraI
509 5’ – GTC CCT TTC AAC ATC ATT G – 3’
510 5’ – GGA GTG CGC ATA ACG AA – 3’
sraJ
505 5’ – GTA TGT GTA GGA TCA AGC – 3’
506 5’ – GCC ACA GTA GTT CCT TC – 3’
sraL
507 5’ – GTC GGT GCG CAA GAT TG – 3’
508 5’ – GCC CGT TGC GTA ACC CG –3’
rprA
513 5’ – GGC GAA ATC GAG AAA CC – 3’
514 5’ – GCC TGC TGA CGG CTT GA – 3’
Primers for primer extension assays
sraB
495 5’ – TGC CAA TAA TTC GCA CA – 3’
496 5’ – AAC CGG ATC GAG AGT CA – 3’
sraC
449 5’ – TCA GCT GAT GAC CAC CA – 3’
541 5’ – TCC CTG GAC CGA ATA CA – 3’
sraD
534 5’ – GAT AAC AAA TGC GCG TC – 3’
sraE
542 5’ – GTA CCG AAT AAT CTC ACC AA – 3’
sraG
539 5’ – AGG GTT GTC ATT AGT GC – 3’
sraH
448 5’ – CGA ATA CTG CGC CAA C – 3’
sraI
470 5’ – CTG GAA GCA ATG TGA GC – 3’
sraJ
480 5’ – CAC TCA ACG TTG TGT CC –3’
sraK
483 5’ – CTG ACC CTC ATC CTG AG
sraL
rprA
Primers for 5’ and 3’ RACE experiments
sraB
5’ RACE
149-A 5’ – CAC ACA TTG CGG GT- 3’
149-B 5’ – TGC GGT TTA CTG CTT TAT – 3’
3’ RACE
149-C 5’ – GTT ATC AGC ACT GAA CGA AAA – 3’
149-D 5’ – GCA GTA ACC CGC AAT GT – 3’
149-E 5’ – TCC ATC AGA TAT AGC GTA TTG A – 3’
149-F 5’ – TAG CGT ATT GAT GAT AGC CAT – 3’
sraC
5’ RACE
101 5’ – CAG CTG ATG ACC ACC A –3’
101-B 5’ – TGA TGA CCA CCA CGC TT- 3’
3’ RACE
101-A 5’ – TGG TCA TCA GCT G – 3’
101-C 5’ – GGT CAT CAG CTG AAA TGT – 3’
101-D 5’ – GTC AGC GAA GGA AAT GCT – 3’
101-E 5’ – GAG ACC GAA CAC GAT TCC – 3’
101-F 5’ – GCC TTG CCC TTT AAG AAT AG –3’
sraD
5’ RACE
150-A 5’ – GGA ATT CAG GGA TGA TG – 3’
150-B 5’ – GCG CGT CTT TCA TAT ACT CA – 3’
150-C 5’ – TCA GGG ATG ATG ATA ACA AAT GCG – 3’
150-D 5’ – TTC ATC TCT GGA ATT CAG GGA T – 3’
sraE
5’ RACE
4-A 5’ – GTA CCG AAT AAT CTC ACC AA – 3’
3’ RACE
4-B 5’ – TTG GTG AGA TTA TTC GGT AC – 3’
SraF
5’ RACE
109-C 5’ – CCG CTG CTT TTT ATG – 3’
109-D 5’ – TAT GCA TAG ACC TCG CCT T – 3’
109-E 5’ – GGT GAC CGG ATG TGT TT – 3’
3’ RACE
109-A 5’ – GTG AGA CCT TGC CGG A – 3’
109-B 5’ – GCC GGA AGG CGA G – 3’
109-F 5’ – GCC GGT CGA TCG TC – 3’
sraG
5’ RACE
444-A 5’ – ATA GAG CTG GGT TAG GG – 3’
444-B 5’ – GGG TTA GGG TTG TCA TTA GTC – 3’
444-C 5’ - CTG ACG GCA GCA ATT – 3’
444-D 5’ – GCA ATT TAC TGG AAA CTA ATG – 3’
3’ RACE
444-E 5’ – GCA TCC TCG CGA CTA AT – 3’
444-F 5’ – GAA CCT CTG CAA CGG AA – 3’
444-G 5’ – GCT GCC GTC AGC TTG – 3’
sraH
5’ RACE
102 5’ – CGA ATA CTG CGC CAA – 3’
102-B 5’ – GAA TAC TGC GCC AAC AC – 3’
3’ RACE
102-A 5’ – TTG GCG CAG TAT TCG – 3’
102-C 5’ – GAT TTC CCT GGT GTT G – 3’
102-D 5’ – GCT GTG CCC TTG TAA CTC – 3’
sraI
5’ RACE
107 5’ – TGG AAG CAA TGT GAG C – 3’
107-B 5’ – GCA ATG TGA GCA ATG TCG – 3’
3’ RACE
107-A 5’ – GCT CAC ATT GCT TCC A – 3’
107-C 5’ – TCA CAT TGC TTC CAG TAT T – 3’
sraJ
5’ RACE
103 5’ – GTC AGT GGA CGA TAA GCA – 3’
103-B 5’ – GGA CGA TAA GCA CCG TAA –3’
3’ RACE
103-A 5’ – TGC TTA TCG TCC ACT GAC –3’
103-C 5’ – GTC CAC TGA CAG ATG TCG – 3’
sraK
5’ RACE
200 5’ – GCC GGA ACA ATC CGT – 3’
200-A 5’ – CGT CTC CGG ACG TTT – 3’
3’ RACE
200-B 5’ – GTC CGG AGA CGT AAT TAA AC – 3’
sraL
5’ RACE
104 5’ – GTT TCC CCC GAC GT – 3’
104-B 5’ – CCC GAC GTC AAC ACA C – 3’
3’ RACE
104-A 5’ – ACC CTC CTG TGT ACC AG – 3’
104-C 5’ – GTA CCA GCG GGA TAG AG – 3’
rprA
5’ RACE
100 5’ – GCA AAG ACT ACA CAC AGC A – 3’
100-A 5’ – CTC AGG GGA TTT CCA T – 3’
100-D 5’ – GAT GGG CAA AGA CTA CAC – 3’
100-E 5’ – GGG CAA AGA CTA CAC ACA G – 3’
3’ RACE
100-B 5’ – TGC TGT GTG TAG TCT TTG C – 3’
100-C 5’ – ATG GAA ATC CCC TGA G – 3’
100-F 5’ – GAA TCT GAT CGA CGC AAA – 3’